Congés maladie ordinaire, longue maladie, longue durée
Les congés pour raison de santé ouverts aux agents publics sont prévus par le code général de la fonction publique et les textes réglementaires relatifs aux conditions d’emploi applicables aux différentes catégories d’agents publics.
Ils présentent un degré de protection croissante selon la nature de la maladie, son niveau de gravité et la nécessité d’un traitement et de soins prolongés.
Au sein du ministère chargé de l’agriculture, la note de service SG/SRH/SDDPRS/2019-344 du 29 avril 2019 constitue la référence en matière de procédure relative aux congés maladies, aux accidents de travail et aux maladies professionnelles.
Des fiches éclairent l’ensemble des services, acteurs et établissements du Ministère, sur ces différents sujets.
Les fiches et annexes sont regroupées dans la note de service du 29 avril 2019 :
- Le congé de maladie ordinaire (titulaires et contractuels) - Fiche 1-A
- Le congé de longue maladie (titulaires et contractuels) - Fiche 1-B
- Le congé de longue durée (titulaires et contractuels) - Fiche 1-C
- Le congé de maladie ordinaire (non titulaires hors) - Fiche 1-D
- Le congé de grave maladie (non titulaires hors) - Fiche 1-E
- Les congés de maladie (CMO de moins de 6 mois) : procédures applicables aux titulaires et contractuels - Fiche 1-F
- Récapitulatif des droits à congé maladie - (Annexe n° 1)
- Congés de longue maladie/congés de longue durée : procédure (Annexe n° 2)
- Mise en congé d’office : procédure (Annexe n° 3)
- Reprise d’activité après un congé de longue maladie/congé de longue durée : procédure (Annexe n° 4)
- Congés maladies : incidence sur les droits à congés, les jours ARTT (Annexe n° 5)
Actualité juillet 2026
Suite à la publication du décret n° 2026-705 du 29 juillet 2026 relatif aux congés pour raisons de santé des agents publics civils et militaires, de nouvelles règles s’appliquent dans la fonction publique, à compter du 1er septembre 2026, pour ce qui concerne les agents en congé maladie.
Pour en savoir plus, consulter l’article publié sur le portail de la fonction publique : Arrêts de travail pour raisons de santé, temps partiel thérapeutique : de nouvelles règles s’appliquent dans la fonction publique.
A noter :
La note de service comprend également des fiches relatives aux accidents de service ou de travail (fiches n°2), aux maladies professionnelles (fiches n°3), aux acteurs (fiche n°4) et enfin à l’aménagement du poste de travail, au reclassement professionnel et à l’inaptitude (fiche n°5).
Pour en savoir plus
- Fiche "La santé au travail et le conseil médical dans la fonction publique", fiche publiée par le FIPHFP, février 2025 ;
- "Congé pour raison de santé", site du portail de la Fonction publique ;
- "Temps partiel pour raison thérapeutique", site du portail de la Fonction publique
- Guide 2025 du temps partiel dans la fonction publique, DGAFP
- Rubrique "Congés et absences liés à la santé", intranet du Ministère chargé de l’agriculture
- "Maladie ou accident du travail dans la fonction publique", publié sur le site Service-public.fr ;
- "Sécuriser le retour d’un agent après un arrêt de travail long", site du ministère dédié aux situations de handicap.
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